Els Laboratoris Hospitalaris de l'Hospital de Terrassa, Hospital Universitari de Mútua de Terrassa i de Fundació Hospital Sant Joan de Déu de Martorell funcionen 24 hores 365 dies l'any. Aquests laboratoris treballen en xarxa com laboratoris d’urgències junt amb el laboratori central a Viladecavalls, disposen dels mateixos analitzadors i comparteixen protocols de treball.

El concepte de Laboratori Hospitalari engloba tant les Urgències mèdiques de l'Hospital com la Microbiologia hospitalària. Des del Laboratori d'Urgències es realitzen les determinacions urgents bàsiques de bioquímica, hematologia i gasometries que també inclouen, entre d’altres, marcadors cardíacs, fàrmacs i drogues d'abús, i serologia infecciosa. La bioquímica es realitza amb mòduls d’analitzadors espectrofotomètrics, immunoquímics i mòduls ISE, i l’hematologia amb sistemes Sysmex XN. Al Laboratori hospitalari de Microbiologia es realitza la bacteriologia del pacient ingressat i les tècniques de Biologia Molecular urgents, disposant de l’equipament necessari per fer cultius, identificacions, antibiogrames i tècniques moleculars. Des del laboratori hospitalari també es gestionen equips POCT, com gasòmetres, que puguin estar instal.lats en diferents localitzacions dels hospitals.
A més, als hospitals de Terrassa i Sant Joan de Deu de Martorell el laboratori és responsable del Banc de Sang, on es fa el seguiment de les bosses de sang i plasma i es realitzen les proves de laboratori necessàries pel seu correcte funcionament.